ترمیم 6o- متیل گوانین به گوانین توسط سیستئین: اثر حلال
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه سیستان و بلوچستان - دانشکده علوم پایه
- نویسنده شیوا رضازاده
- استاد راهنما علی ابراهیمی مصطفی حبیبی خراسانی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1391
چکیده
جزئیات فرایند ترمیم 6o- متیل گوانین (o6mg) توسط سیستئین (cys145) در چندین مدلسازی با روش b3lyp/631+g* در دو فاز گازی و محلول مورد بررسی قرار گرفت. برای آنالیز برهمکنش های ایجاد شده بین o6mg و cys145 و دیگر اجزای واکنش، مقادیر چگالی الکترونی در نقاط بحرانی پیوند (?bcp) و انرژی-های برهمکنش دهنده-پذیرنده (e2) به ترتیب توسط روش های اتم ها در ملکول ها (aim) و اوربیتال پیوندی طبیعی (nbo) محاسبه شده است. همچنین، بارهای اتمی chelpg و توزیع بار در سطح نظری ذکر شده بررسی شده است. مدل سازی های صورت گرفته به منظور 1) بررسی نقش و توالی انتقال پروتون از cys145 به o6mg، مقدم بر انتقال گروه متیل در فرایند ترمیم باز آسیب دیده، 2) فرایند ترمیم با واسطه مولکول های آب و همچنین 3) بررسی فرایند در محیط اسیدی انجام شده است. انتقال پروتون از cys145 به o6mg قبل از انتقال گروه متیل از o6mg به cys145، فرایند ترمیم را تسهیل و سد انرژی این فرایند را کاهش می دهد. انتقال پروتون از طریق مولکول های آب پل شده بین o6mg و cys145 سد انرژی فرایند ترمیم را کاهش می-دهد. همچنین محیط اسیدی در کاهش این سد انرژی نیز موثر می باشد.
منابع مشابه
بررسی نقش پلی مورفیسم‌های ژن O6 – متیل گوانین متیل ترانسفراز در سرطان کولورکتال
Abstract Background: Sporadic colorectal cancer is the fourth most common cancer in Iran. The DNA repair protein O6-methylguanine-DNA methyltransferase (MGMT) is involved in the cellular defense against alkylating agents. Genetic alterations in the MGMT gene may impair the protein’s ability to remove alkyl groups from the O6-position of guanine, thereby raising the mutation rate and increasi...
متن کاملبررسی نقش پلی مورفیسم های ژن o۶ – متیل گوانین متیل ترانسفراز در سرطان کولورکتال
چکیده سابقه و هدف: با توجه به شیوع و روند رو به افزایش سرطان کولورکتال و اهمیت اتیولوژیک این سرطان و وجود گزارش هایی مبنی بر نقش احتمالی پلی مورفیسم های ژن های مختلف در بروز بیماری هایی از قبیل سرطان ها و علاوه بر این عدم وجود گزارشی در ایران مبنی بر ارتباط سرطان کولورکتال با پلی مورفیسم های 06- متیل گوانین متیل ترانسفراز (mgmt)، که پروتئین دخیل در ترمیم مولکول dna و عامل محافظت سلول در مقابل ع...
متن کاملبررسی سینتیکی مرحله ی مبادله گوانین نوکلئوتیدها در فاکتور طویل شدن در سنتزپروتئین به روشهای محاسباتی
در این تحقیق سنتیک و مکانیسم تعویض گوانین نوکلئوتید ها در فاکتور طویل شدن مورد بررسی قرار گرفته است. در این فرآیند gtp وgdp بعنوان سوبسترا به فاکتور طویل شدن اتصال می یابند .سنتیک این فرآیند با حل معادلات دیفرانسیل معمولی (odes) به کمک نرم افزار matlab شبیه سازی شد. با استفاده از نتایج شبیه سازی عددی و تقریب حالت شبه پایا ، یک معادله ی سرعت برای این فرآیند پیشنهاد شد. برای بررسی تاثیر عوامل مخت...
15 صفحه اولبررسی برهم کنش اکتینومایسین d با dna چهاررشته ای غنی از گوانین توسط روشهای آزمایشگاهی و مدلسازی مولکولی
ژن c-myc نقش مهمی در تنظیم رشد و تکثیر سلولی ایفا می کند و بیان بیش از حد این ژن در گستره وسیعی از سرطان های انسانی دیده شده است. حدود 90% رونویسی ژن c-myc از طریق یک توالی 27 نوکلئوتیدی غنی از گوانین بسیار حساس به نوکلئاز بنام nuclease-hypersensitive element iii (nhe iii) کنترل می شود که این توالی قادر به تشکیل ساختار g-quadruplex تحت شرایط فیزیولوژیک است. بنابراین dna ژن c-myc یک هدف مناسب بر...
15 صفحه اولمطالعه نقش الیگونوکلئوتیدهای حاوی سیتوزین ـ گوانین در تولید اینترفرون گاما و ایمونوگلوبولین ـ ای در پاسخ به آلرژن کنوپودیوم آلبوم در مدل موشی آسم
Background & Aim: and achieving safe prophylactic and therapeutic procedures is the main aim of the investigators. CpGoligodeoxynucleotides (CpG ODN) which modulate the immune responses and change the cytokine patterns by severalmechanisms are among these procedures.Worldwide increasing number of allergic disorders is one of the most important health challenges,Material and Method: Chenopodium ...
متن کاملاندازه گیری الکتروشیمیایی انسولین, گوانین و آدنین با استفاده از الکترود خمیرکربن اصلاح شده با سیلیکاژل
در بخش نخست این تحقیق، از الکترود خمیرکربن اصلاح شده با سیلیکاژل برای اندازه گیری انتخابی انسولین استفاده شده است. نتایج تجربی نشان دهنده افزایش جریان دماغه اکسایش انسولین در نتیجه جذب انسولین در سطح الکترود اصلاح شده می باشد. بنابراین، الکترود اصلاح شده به عنوان حسگر الکتروشیمیایی در روش های ولتامتری عاری سازی جذبی پالس تفاضلی و آمپرومتری مورد استفاده قرار گرفت. تاثیر پارامترهای مختلف تجربی بر...
15 صفحه اولمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه سیستان و بلوچستان - دانشکده علوم پایه
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023